湧蓮寺廟宇建築體座落於蘆洲市街中心的得勝街與成功路口，整體建築為前半部的湧蓮寺與後半部的懋德宮合祀型態的廟宇，早期以傳統閩南式平面四合院式廟宇建築，歷經日治時期大正八年（西元一九一九年）以及民國五十五年的兩次重建，現行建築主體則是民國七十年再次擴建，成為以鋼筋水泥為主體的現代樓宇寺廟。
湧蓮寺座向採坐北朝南方向，格局方正，依據縱身中軸線成左右對稱分布的原則，整體建築空間仍沿襲傳統臺灣佛寺的規矩，如山門、水池、前殿、拜殿、正殿、後殿、天王殿、三寶殿、凌霄寶殿、鐘鼓樓、廂房金亭等相當齊全。湧蓮寺在各殿屋頂結構上採用大量的歇山頂及重簷形式屋頂，予人崇高華麗之感。在各殿使用各種造型的藻井，成為湧蓮寺的最大特色。湧蓮寺在廟宇內外裝飾主要採用剪黏泥塑、彩繪、木雕、石雕等方式，最特殊的技法是有為數不少的飛天樂伎雀替，在其他寺廟尤為罕見，在後殿懋德宮前方，裝置了佔滿壁面以鄭成功史蹟為主的青銅浮雕，中間為「荷蘭降鄭圖」，左右各為延平郡王簡傳、鄭成功坐像，懋德宮沿革志等，這種以大片現代化式青銅浮雕裝飾的作法，在臺灣廟宇中也十分少見。湧蓮寺門外兩側各立一尊佛教護法神，左韋馱柱杵，右伽藍持槍托塔，高度近一丈，全身青銅精鑄而成，造型威嚴有力，雕塑技藝精湛，是不可多得的現代青銅塑神像作品。縱觀湧蓮寺整體建築，在現代化建築主體中，也大量保留了傳統道廟的題材來裝飾，大量採用現代式建材與裝飾手法，其中又使用不少傳統素材及匠藝，都是湧蓮寺廟宇建築中現代與傳統包容兼蓄的特色。